Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms