Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms