Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms