Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms