Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XKR8Q9H6D3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms