Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms