Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RSG1Q9BU20 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms