Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms