Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGIP1Q9BQI5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms