Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms