Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BORCS6Q96GS4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms