Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms