Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDAC11Q96DB2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms