Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms