Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms