Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms