Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf43Q8TAL5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms