Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms