Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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