Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS8Q8N3P4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms