Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC117Q8IWD4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC117Q8IWD4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms