Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRCQ7RTU9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms