Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms