Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LRRC8EQ6NSJ5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms