Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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