Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms