Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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