Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms