Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALFQ53S48 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms