Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms