Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL12Q53G59 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms