Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC153Q494R4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms