Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms