Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms