Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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CCDC142Q17RM4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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