Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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