Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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