Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NEDD8Q15843 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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