Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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