Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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