Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms