Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRKQ15262 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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