Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PCM1Q15154 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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