Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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