Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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