Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GBX1Q14549 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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