Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms