Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM25Q14258 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms