Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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