Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKP1Q13835 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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